В фаноне были популярны несколько вариантов.
Во-первых, джедаи даже толком ещё пленников не освободили когда ловушка захлопнулась. Они не могли уйти с планеты своими силами, и даже удержать позиции.
Джеонозианцы, кстати, имели ручное оружие, эффективное против (типичного) джедая в условиях сухой планеты - звуковые пушки.
Плюс много дроидов. Производство дроидов.
Плюс ПКО, хотя и не очень сильное по меркам пред-Явинской Империи, но джедаям хватало.
Во-вторых политическая версия. Когда начать войну (особенно локальную, в духе недавней войны Старка) проще, чем разбираться с политикой Старой Республики. Тем более что Джеонозис имел довольно особый политический статус (ещё более особый, чем типичные миры разумных роевых насекомых) и там как раз проходило околополитическое мероприятие...