Дело не во влиянии религии (господи, вот же жупел), а именно в брезговании практикой.
В какой-то мере насчёт научного метода вы правы, но отчасти - а именно в том, что оный научный метод так и не дошёл до пункта "а теперь давайте проверим ваши выкладки на практике на живом (пока что) больном".
Пока шла речь о постановке диагноза, он существовал, применялся... но дальше вступала вдруг совершенно античная протонаука с её манией "чистых рук", и лечение планировалось исходя из диагноза совершенно умозрительно, согласно модной в отдельно взятый период теории, а если оно не помогает - это больной неправильный, на бумажке всё было верно.