Скажу про свой опыт. Детство в 1990-е и начало 2000-х. Идеологически выверенных кружков не было, зато было разнообразнейшее чтение, а читала я много и с удовольствием: советская классика с антирелигиозной направленностью, тут же восторженно-религиозная православная монархистка Чарская, а ещё классика зарубежной литературы, пропитанная в основном протестантскими идеалами и полная отсылок к Библии. Ну и сама "детская Библия". Я бы сказала, что вынесла из этого чтения если не критическое мышление, то понимание, что в разные времена и в разных странах бывали разные идеологии, а ценности в итоге у всех положительных персонажей примерно одинаковые.
Но это были не кружки. Это была классика. Литература на все времена, просто не способная нанести вред психике.
Критическое отношение к пропагандам всяким у нас дома скорее витало в воздухе, сказывалось в разговорах, в оценках, обсуждениях, поступках. В том, как выпроваживали из дому свидетелей Иеговы или отмахивались от них на улице, например. Вообще как-то обсуждались секты и последствия попадания туда - просто среди всех прочих новостей и событий. Секты, мошенники, аферисты - всё это было неподалёку, в ассортименте, и я росла с мыслью, что есть такие вот люди и группы, от которых надо держаться подальше.
Так что, по моему опыту, решающую роль в воспитании играют те ценности, какие проявляются в действиях взрослых, с которыми ребёнок растёт. Кружки, книги, школы - второстепенны.