"Герои с зелеными глазами имеющие некие сверхспособности или же велиеое предназначение, это просто совпадение или же уже штамп?".

Погодите, так ведь можно сказать про любого колоритного персонажа... Зеленые глаза не могут быть штампом и совпадением. Это просто глаза.