Так а меч для неё вроде был просто дорогой цацкой, принадлежащей одному из Основателей, к вещам коих Лорд питает слабость. Вряд ли она подразумевала, что мечом можно уничтожить хоркрукс (как и Лорд, видимо. Про то, что его искупали в яде василиска они прост не думали.). Белка испугалась, что раз они взяли из сейфа меч основателя, то могли там и чашу другой основательницы прихватить. Скорее всего, логика была примерно такой.
Ну а что там с Лонгботтомами было - вообще поле для любых фантазий. Мы же не знаем, что там как было в деталях и кто больше всех старался. До Азкабана-то Белка явно была спокойнее и уравновешеннее.