Ну, Флер же - внучка вейлы. И если судить по канону, то вейловские чары у нее развиты в достаточно сильной мере. Скорее всего Билл как-то мог противостоять ее магии, поэтому она сначала ценила и уважала его уже за это, а после ранения и вовсе не могла его оставить. К тому же по книгам и по фильмам видно, как меняется характер Флер под влиянием Билла. Из самоуверенной и надменной девочки, какой она была в четвертой книге, она стала доброй и мудрой женщиной, верной женой и любящей матерью, так что нельзя сказать, что брак с Биллом стал ошибочным решением.
А где она пересеклась с Биллом, что между ними такое произошло, что заставило ее отказаться от родной Франции и переехать в неприветливую на тот момент Англию? Можно лишь догадываться или придумывать самому. Канон об этом не распространяется.