Таникадзэ Нагатэ/Хосидзиро Сидзука (Хошидзиро)/Синатосэ Изана (Шинатосэ)

Главный герой, воспитанный своим «дедом» Сайто Хироки глубоко внутри Сидонии, из-за чего он отличается от прочих граждан — к примеру, лишён способности к фотосинтезу и должен есть каждый день, как обычный человек. В дальнейшем становится ясно, что он на самом деле клон Сайто, генетически получивший способности к быстрой регенерации и бессмертию — что вообще-то запрещено даже для Совета, бессмертие которых обеспечивается путём приема соответствующих препаратов время от времени — а также унаследовавший природные таланты Сайто как пилота и воина. На Нагатэ возложили управление мехом Сайто, легендарным Тип-17 Цугумори, и в конце концов он стал лучшим асом Сидонии, неоднократно спасая корабль от нашествия Гауна. Позднее ему поручили испытание опытного образца новой модели Стража, Тип-19, с улучшенной боеспособностью. Пилот № 704

Пилот стража, занимающая номер два среди стажеров, небезответно влюблена в Нагатэ. Позднее была убита и поглощена Гауна, которая использовала её ДНК и воспоминания для создания сильных «Стражей Гауны», самая умная и опасная из которых была известна как Алый Бражник или Алый Мотылёк. Образец плаценты (оболочки Гауна), напоминающий Хошидзиро, был извлечен Нагатэ, и Отиай импрегнирует его, используя человеческую ДНК, чтобы создать Цумуги и Канату. Пилот № 702