Кабинет Минервы МакГонагалл находится на втором этаже замка Хогвартс. Используется как рабочий кабинет и спальня (либо в кабинете стоит ширма, либо, что вероятнее, кабинет двухкомнатный). С сайта Pottermore можно узнать, что кабинет находится в башне ЗоТи и в него можно попасть через тайную дверь в потолке.
В 1991 году в кабинет МакГонагалл завхоз Филч привёл Гарри и Гермиону, пойманных после того, как они отправили дракончика в Румынию. Здесь же оказался попавшийся ранее Невилл. За перемещение по Хогвартсу в ночное время декан назначила всем троим строгое наказание.
В 1993 году вернувшиеся из Тайной Комнаты Гарри, Рон, Джинни и Локхарт направились вслед за Фоуксом в кабинет МакГонагалл, где помимо хозяйки обнаружили Дамблдора с мистером и миссис Уизли. Здесь прошла большая часть событий заключительной главы, включая беседу Гарри с Дамблдором и затем их совместное общение с Люциусом Малфоем (при участии Добби).
В 1994 году после прибытия студентов в Хогвартс МакГонагалл пригласила в свой кабинет Гарри (в связи с обмороком, испытанным им в поезде при появлении дементора) и Гермиону (с которой обсудила её расписание уроков). В дальнейшем (после первого проникновения в замок Сириуса Блэка) декан вновь вызвала к себе Поттера, чтобы предупредить его об опасности и решить вопрос с вечерними тренировками в квиддич.
В 1995 году в кабинете МакГонагалл прошла консультация по вопросу выбора Поттером профессии (помимо самого Гарри и декана, при этом присутствовала также Амбридж).
В 1996 году, после проклятия Кэти Белл, МакГонагалл привела к себе в кабинет Лианну, Гарри, Рона и Гермиону, чтобы расспросить их о происшествии.
В фильме «Гарри Поттер и Философский камень» профессор МакГонагалл наблюдала за Гарри Поттером, который в последний момент поймал запущенный Малфоем маленький шарик-напоминалку на уровне окна кабинета. Создаётся впечатление, что это — высота третьего, а то и четвёртого этажа.