Если вы действительно читали этот фик и посмотрели в шапку,то заметили бы, что автор следует объяснениям БИ. В довольно развернутом виде авторы БИ излагают мысли по-поводу поведения Снейпа. Здесь автор художественно обработал эти соображения, так что можно почитать в двух вариантах и разобраться, что двигало Снейпом.
А вообще учителя тоже люди, у них бывают изредка бытовые проблемы - даже идеальные учителя могут позволить себе слегка нахмуриться или повысить голос? Испытывать симпатии и антипатии?