Кхм.
Начнем с того, что Артуриана - это цикл французских (по большей части) средневековых романов, созданных на обрывках кельского эпоса. Это раз. Жил ли Артур, не жил ли - достоверно не известно до сих пор, это два. Соответственно, неизвестно, существовал ли Мерлин или его присочинили месье де Труа с компанией; если и жил, то был максимум друидом и близким советником племенного вождя (короля) Артура.
Христиане века так с 11-го, а то и раньше, крайне отрицательно относились к колдунам. У Роулинг идут достаточно крупные привязки к событиям реальной истории (Гриндевальд и ВМВ, например); если сопоставить дату принятия Статута и события реальной ака маггловской истории, то можно сказать, что маги ушли в подполье... ближе к концу повальноевропейской "охоты на ведьм". Т.е., магглы банально задавили их числом, обнаружив, что жуткие слуги Сатаны ака колдуны живут совсем рядом, под боком, можно сказать. Не было никакой потери власти - было банальное желание истребить то, чего люди не понимали, не принимали и не желали этого делать.