Предположу три варианта:

3) Есть разница между Наполеоном и пациентом больницы для заблудших странников, считающим себя Наполеоном. Странник может быть таким же талантливым, как Наполеон, и даже похожим внешне на него, но настоящим Наполеоном он не станет. При этом пациент до обострения расстройства старательно и подробно изучал биографию Наполеона, и именно эти знания позволяют ему вжиться в роль, примерить жизнь Наполеона на себя. А родные и близкие всегда узнают своего странника, они не спутают его ни с настоящим Наполеоном, ни с другими пациентами.

Действия варны не оживили Волан-де-Морта, а спровоцировали шизофрению Арчера.

6) Это реинкарнация, Том просто вспомнил свою прошлую жизнь. Это не была замена одной личности на другую, а просто открытие памяти предков. Скоро откроются воспоминания Гонтов, потом Слизеринов, затем арабских завоевателей Испании, а оттуда до египетский змеепоклонников, а оттуда и предки из Атлантиды всплывут.

4) Гарри в прошлый раз видел борьбу Арчера и дневника, а в этот раз острой и явной борьбы нет.

5) Все решает опыт! На втором курсе Реддл из дневника и Арчер были неопытными, а тут Арчер старше на пару лет, а Волан-де-Морту вообще за шестьдесят. Плюс у Арчера есть отрицательный опыт того, как не стоит показывать свою одержимость Поттеру.

2) Гарри на самом деле понимает гораздо больше, чем показывает, он строит свои планы, но скрывает их от всех. Поттер прощупывает Тома, изучает его, он догадалася обо всем или скоро догадается, но виду не покажет. Это ведь тайна. В курсе могут быть только Луна и, может быть, Дафна.