Hexelein
То, что Гермиона изменила матери память, НИКАК (простите за капс, здесь нет выделения шрифтом или я не вижу) не повлияло на то, что та видела или не видела.
Та по-прежнему видела странные вещи, как и показано в начале повествования.

Потому что Гермиона поменяла память, но что именно менять она не знала, пока не заглянула в воспоминания матери. Она вырезала свою линию. Но обрывки остались

Что именно - "зачем"? Зачем это в фанфике? Или зачем это понадобилось тем неизвестным волшебникам?