PPh3
Во время истории с василиском Дамблдор был директором, а Фламель - только наблюдателем от министерства и профессором истории магии. Причин не сообщать в министерство было много, одна из них - не привлекать к пострадавшим внимания, которое в дальнейшем может помешать им строить свою жизнь в мире магии.

Сложно сказать, насколько я поняла из Фантастических Тварей, разделить сущности без смерти носителя очень сложно. Так же, как разделить хоркрукс с живым носителем, например, - это свойство нематериальных паразитических образований.

Ограничений по открытию новых школ нет, но Хогвартс в данной вселенной не просто учебное учреждение, а, в некотором роде, магическое явление. Пока он существует в нынешнем виде, любая другая школа будет ему проигрывать.

Вот начнется пятый курс - и с пророчеством многое прояснится. Пока что максимально приблизиться к разгадке удалось только двум из упоминавшихся в фике персонажей - и еще один начинает об этом догадываться.

Bombus
История еще далеко не закончена, так что рано подводить итоги.