Полагаю, лучше спрятать. Если филактерия - это исключительно "якорь", и не требуется для чего-то ещё, то есть, например, её не нужно кому-то найти для воскрешения.

Итак, вижу много вариантов, куда можно спрятать филактерию так, что её будет проблематично найти. Если защищать её лично, то... Всегда есть вариант проспать атаку, попасть под атаку массового поражения (взрыв, пламя дракона), погибнуть в таком месте, которое вредно для филактерии (Азкабан?), погибнуть в каком-то месте, куда легко смогут добраться охотники за флактерией. Кроме того, наличие филактерии в кармане будет сковывать владельца - он будет вынужден соблюдать дополнительные меры предосторожности. Если же аппарировать крестраж в рандомную точку мирового океана, замаскировав под простой булыжник, то найти его будет очень тяжело.
С другой стороны, всегда есть вариант, что появятся новые хорошие поисковые чары. С третьей стороны, наш лич может сам вести исследования по изобретению чар по поиску филактерий (ну, не лично, а нанять команду исследователей), и если окажется, что теперь найти "иголку" легко, он её сможет найти сам и перейти к варианту "носить при себе"