ЭваМарш
Я подозреваю, что потому, что Гермиона заучила тезис "Снейп - человек Дамблдора", но веры в это у нее нет. Данные, не знания. То есть, не интегрированная система. А у Гарри именно вера, что Снейп желает ему зла. Вот в критической ситуации вера и пересилила данные настолько, что Гермиона тоже не вспомнила.