Дополню, что о Комнате-по-Требованию скорее всего знает не так много народу на самом деле. Иначе было бы туда ходили все, кому не лень и про нее не знали только тыквы у Хагрида. Как оно часто бывает - комнату нашел Джон, рассказал "по секрету" лучшему другу Стиву, тот "по секрету" Грегу, Грег привел туда Мэри, Мэри рассказала Джейн...
Скорее всего, о комнате знают домовые эльфы, хотя бы как о месте где можно найти инструмент и прочие нужные вещества, ну и те, кто не побрезгует их расспросить. Можно даже предположить, что она под особой разновидностью Фиделиуса, а эльфы - хранители Тайны... Но это лишь фантазия.
Учитывая, как волшебники в большинстве своем относятся к эльфам и вообще всем, кто не волшебник, ничего удивительного, что о ней знает не так много народу. Ну а учитывая, что Том считает что он "гигант мысли, отец Британской магократии" и вообще, самый умный, то он вполне мог решить, что больше никто не догадается найти КпТ.
А склад вещей вполне обьясним. Во-первых, Хогвартсу минимум тысяча лет (может и больше, учитывая, что там учился Мерлин). За это время могло накопиться много чего. Во-вторых, запросто могло случиться, что на комнату мог наткнуться кто-то, с кучей барахла, которое и девать некуда, и выкинуть жалко, или просто кому-то нужен был склад. В-третьих, груды хлама могла создавать сама Комната, чтобы вних можно было прятать вещи. Ну и в четвертых, Комната может быть местом, куда эльфы стягивали все, что обитатели замка теряли в других местах.