Ярик
Возможно, сам факт активации приказа изменяет взаимоотношения. Если раньше это был просто "избранный Канцлер", то после подтвержденной измены командования - уже включаются какие-то чрезвычайные полномочия.
Просто достаточно трудно представить, чтобы жидаи, с их многовековым опытом мозгоклюйства, и наличием огромного количества подопытного материала (раненых клонов на исцелении) прохлопали такую бомбу.
А вот если приказ 66 - обычная практика (скажем, на случай Падения конкретного командира на Темную Сторону) - то вполне могли пропустить возможность использования этого приказа не против конкретного командира, а против всего Ордена в целом.