Я не писала рациональная = темная. Это, конечно, не так. Но темная сторона в случае Гарри определенно более рациональная, чем любая другая.

Ваш комментарий расстроил меня и заставил вернуться к 89. По-моему, в фанфике, как и в каноне, мы видим то, что происходит, глазами персонажа. В данной части главы мы "смотрели" через глаза ГП и видели то, что видел он.
Вероятнее всего, вы правы и Гермиона мертва, но мне сложно поверить, что такой перспективный персонаж выбыл из повествования. Маховиком ее воскресить нельзя, воскрешающего камня, даже если он действительно воскрешает, у героев нет и способа, позволяющего возвращать к жизни, волшебники не знают (по крайней мере не знает Дамблдор, а он один из сильнейших магов современности), так что в ближайшие годы Гермиону вернуть нечем, разве что она не станет призраком.
Мне сложно поверить, что автор вывел ее из повествования так надолго или даже навсегда, поэтому предполагаю, что она изначально не умирала.

Гарри за короткий временной промежуток потерял двух из трех важнейших для него в Хогвартсе людей. Кто-то пытается побудить его к активным действиям. И я не вижу никого, кому реальная смерть Грейнджер была бы выгоднее, чем заточение девочки в сундуке до критического момента.

Ну а на самом деле мне она мне нравится и поэтому хочется верить, что жива =)