А был ли штурм Министерства?
Часть Министерства была под контролем УпСов.
И одним прекрасным вечером они, вероятно используя дыры в безопасности, организованные с помощью людей под Империо (тот же Пий), вошли в полупустое Министерство (ибо вечер), пленили/убили своих противников в нем. Затем разослали по домам некоторых противников ударные группы, которые пленили или захватили их там (такая группа посылалась на свадьбу Уизлей за Поттером и другими, но не справилась). Неясно где захвачен и убит Скримджер, в Министерстве или где-нибудь еще.
А на следующее утро страна и большая часть авроров узнали, что министр заболел и ушел в отставку, что вместо Скримджера Пий, который произвел некоторые перестановки.
Сами авроры организовываться на сопротивление то ли не смогли, то ли не захотели. И так власть перешла к Волдеморту.