TheWitcher, из здешних навскидку вспоминаются Banking on Her, Предательские деяния, Французская магия. Пусть это не таймтревелы, но все-таки. В первом случае Снейп лишается магии и разума, во втором - остается жив, но теряет одну руку и оказывается в Азкабане, в третьем его убивают.
Есть еще один фик на хогнете, таймтревел, называется "Своя сторона". Там Гарри убивает Снейпа еще до школы, перед этим наградив его порцией "Круцио", заодно выпытав у него планы ДДД на самого Гарри. Фик не ахти, но что вспомнилось. Если интересно, вот ссылка.
http://hogwartsnet.ru/mfanf/ffshowfic.php?fid=48254&l=0

Наверняка, есть еще подобные фики, но то ли я их забыл, то ли мне они еще не попадались.