Не, с точки зрения литературы то всё понятно (там, наверно, большая часть нелогичных моментов присутствует именно ради лучшего понимания читателем мыслей автора). Но вот в приложении к реальности... У меня была мыслишка, что это может быть остатком старого Хогвартса, мол при перестройке три других факультета получили башни, или существенно их расширили, а у Слизерина всё и так было хорошо. Также, если принять, что слизеринцы сидят в этих помещениях почти с самого начала, то за тысячу лет этаж вполне мог оказаться засыпаным культурным слоем, или, тоже идейка - зимы были холодные, самообогрева\домовиков ещё не было, и школьники на зиму забивались по подвалам, и соответственно более сильные\благородные отбили себе самую лучшую часть подвала. Но вариант с культурным слоем мне кажется более интересным =)