Да вы шутите. Джедаи - просто миротворцы и хранители Республики, которые выполняют свой долг. Что они, почуяв слабость своей родины, должны были бросить её на растерзание Конфедерации? Или вообще предать и поддержать противников? С чем жили - то и защищали.
С Анакином Оби-Ван правильно поступил. Этот ублюдок сначала предал своих, потом выдал их секреты, открыл дверь солдатам, а сам пошёл делать "грязную работу" - убивать юнглингов, видимо, опасался, что у кого другого на детей рука не поднимется. Потом довёл до самоубийства женщину, ради которой вроде как пошёл на предательство, и попытался убить того, кто заменил ему отца. И Оби-Ван не собирался убивать Анакина с самого начала. Он его в итоге и не убил, а то, что ноги отрубил и в лаве оставил - так что он должен был, плюшками Эни после всего этого угощать? На его месте я бы прикончил Эни, но у Оби то ли мораль, то ли принципы, то ли вера в пророчество взыграла...