>«вживить» томату ген… базилика - не бывает гена базилика, как не бывает гена свинью, медузы или гена человека

Чушь. Определённые гены и их варианты свойственны определённым видам живых организмов, составляют их генофонд, и выражения вида «ген одуванчика» абсолютно нормальны и научны. Допустим, вот: «Поскольку организация генов у самых разных растений сходна, используя ген арабидопсиса в качестве "зонда", можно выделить его аналог из ДНК любых других растений, в том числе из хозяйственно ценных».

Отсюда: http://www.pereplet.ru/obrazovanie/stsoros/1012.html

>во-первых, "Соросовский образовательный журнал" не является авторитетным источником информации по данной теме

А чем не нравится? Из-за личности Сороса? (-:

>Т.е. в абзаце речь в целом идёт о конкретных генах признаков и свойств

Так конкретный ген всё ещё остаётся геном арабидопсиса. Я просто выбрал пример, который совсем уж никаких сомнений не оставляет. И я могу ещё сколько угодно таких примеров привести, несмотря на то, что в научных статьях речь о генах вообще как таковых заходит реже, чем о конкретных генах:

«При этом каждый ген человека содержит в среднем три МЭ» — https://biochemistrymoscow.com/ru/archive/2018/83-03-0291/#_pdf

«В совокупности около 40% генов дрозофилы на сегодняшний день содержат вставки Р-элемента в кодирующей или регуляторной части гена» — http://ontogenez.org/archive/2020/4/Ont4_20v51.pdf

«Данные, объединяющие информацию по нокауту того или иного гена мыши, собраны на сайте международного проекта IMPC» — http://actanaturae.ru/2075-8251/article/download/10529/pdf

>это жаргонизм, который часто используют научные сотрудники для краткости

Я настаиваю, что такое словоупотребление совершенно обычно, нормально и распространено и не будет ошибкой ни в каком стиле речи. Оно означает принадлежность гена к определённому геному и больше ничего, не надо вкладывать в него посторонние смыслы. Я понимаю, когда такое словоупотребление отвергают, то имеют в виду универсальность генетического кода. Ну так и говорите! А «не бывает гена свиньи, медузы или гена человека» — это полная чепуха, и люди даже несведущие в биологии это чувствуют. Это только вредит популяризации генной инженерии.