Scaverius
Тут исторические заморочки могут быть немного другие.
Такое произнесение отчества - это на болгарский манер. Там и сейчас так говорят отчество, если нужно, - оно там реже используется.
А в России как раз время радения за братушек болгар и прочий панславянизм. В этом русле за два года до "Отцов и детей" Тургенев опубликовал роман "Накануне", главным героем в котором был болгарин Инсаров, в конце романа уехавший бороться с турецким игом в своей Болгарии.
Так что Базаров мог использовать болгарскую форму отчества, выражая таким образом симпатию к воюющей за свободу Болгарии.