Это будет иметь смысл если супергероем будет Хоумлендер или на худой конец Роршах, а если кто-то сердобольный типа Питера Паркера, то как бы гхм...

Это была бы сверхдедовщина с супердедами.)))

Мне кажется, что призывников со сверхспособностями не трогали бы, так как:
1) Можно получить (вставьте нужную суперсилу) в ответ.
2) Командиры три шкуры сдерут за нанесение вреда важному активу государства.

Возможно, произошёл бы какой-нибудь инцидент, где окончательно сломленный обладатель силы уничтожил бы в одиночку всю воинскую часть. После него:
а) Искоренили бы дедовщину, как явление. Потому что никто не хочет повторение такой катастрофы.
б) Обладателей суперсил перевели бы в отдельные воинские части, но среди обычных призывников дедовщина не прекратилась бы.