"Стихийный окрас" чакры это я так понимаю склонность некой чакры к определённой стихии, определяемая посредством бумажки. Может быть одна и только одна. Это канон. Возможно две и более могут быть у обладателей стихийного кеккен-генкай, неизвестно. От чего зависит не понятно, но известно что за изменение свойства чакры отвечает Ян составляющая, которая у шиноби представляет собой энергию всех клеток тела. Проще говоря стихия определяется телом. А значит от попадания скорее всего не изменится.
Кстати, я не верю, что чакра является смешиванием. Согласно Мадаре объединение Инь и Ян усиливает собственную чакру чакроюзера. Которую имеют все (ну люди, животные и часть растений) живые существа в Наруто. Как это объединение происходит? Возможно они просто с этой чакрой смешиваются.