![]() |
Lost-in-TARDIS Онлайн
25 августа 2017
|
Матемаг
Секвенатор - это общее название установок для чтения нуклеотидных последовательностей. Методы бывают совершенно разными, там у каждого своя химия, свои примочки, свои плюсы-минусы и своя цена. В силу технических ограничений этих методов, прочитать всю последовательность на лимон-другой нуклеотидов нельзя, её приходится разбивать на более удобоваримые куски по сотням нуклеотидов - риды (см. выше). Чтобы это всё потом можно было собрать как паззл и знать, что за чем идет, риды перекрывают друг друга. То есть, если у нас есть AGCTAGCA, мы не можем собрать её из двух ридов AGCT и AGCA, мы не будем знать, какой из вариантов верный - AGCTAGCA или AGCAAGCT. А из AGCTAG и CTAGCA - сможем. Когда мы разбиваем последовательность на риды (подготовительный этап, еще до загрузки в секвенатор), всё это происходит случайно, и после всего-всего-всего мы получаем гигабайты кусков как выше, которые нам теперь при помощи хитрой биоинформатики надо будет сложить в одну последовательность. В силу малых длин ридов и случайной разбивки, как я писала выше, заразить секвенатор слету при чтении очень проблематично (даже если не вдаваться в то, как внутри себя он кодирует каждый прочитанный символ, и может ли из такой кодировки прочитаться вирус). Что там еще происходит и реально ли хакнуть комп через прочитанный генетический код - это уже в сообщении выше. |