Потому что физиология мозга. Если очень упростить и популяризировать, то через моторную память при записи от руки в мозги так или иначе попадает куда больше информации, чем при печати. Больше только когда шпоры от руки пишешь, да. И "набить" в долговременную память при использовании личного рукописного конспекта многим (впрочем, это зависит от типа восприятия и некоторых других личных особенностей, включая наличие проблем с суставами рук например) проще и надёжнее.
Ну а правильно писать конспекты от руки - это отдельный навык, который есть очень, очень не у всех. И этому не учат в большинстве школ и даже ВУЗов.