Kidam
"В утробе матери" - тоже вполне годное основание. Чакра влияет - у Наруто и у Гаары есть родовые отметки от соседства с бижду с младенчества, у Нарика они передались по наследству. Мама прокачала Шаринган, ребёнок, будь хоть трижды от гражданского, получит Шаринган тоже.

Вторичные стихии - с ними так же как и с первичными, просто освоить в разы и разы сложнее, да и человек, освоивший, может уже давно завести детей, которым это добро не перейдёт. Может Эпоха вооющих кланов и поспособствовала распространению - ведь человек раньше выучит все возможные дзюцу, а уж затем даже получит пубертат.

Но, допустим, какой-то добрый человек был ппц настойчив и талантлив, и выдрочил Хьётон. Женился (вышла замуж), начал передавать детям свои знания (как Дай Гаю), учить тому, что знает. Детям пробудить чуть легче. В следующем поколении чакра Хьётона уже проще.

Что касается дзюцу, среди владельцев вторичных стихий очень часто встречается кейтайхенка - тот же (та же, лол) Хаку управлял льдом напрямую, из-за этого остался сиротой. Нарик, заполучив ворох стихий от биджу научился их лепить на ходу (у него контроль был запредельный на тот момент, а манипуляция формой - это было его единственное дзюцу).

Что касается Хаширамы, уверен, попадись Нарику свиток, по которому учили Ямато (или возьмись буратино его обучать), Нарик Мокутон освоил бы влёт. Он - Асура. Он - Хаширама. И даже если бы этого не было, его протез - клетки предыдущего воплощения.

О, кстати, о влиянии чакры на тело. Освоенный Хаширамой Мокутон привёл к появлению этой жути с клетками.