Все зависит от категории дела и от применяемой системы. Презумпция невиновности в уголовном (!!!) процессе сейчас считается стандартом, но так было не всегда (хотя принцип известен еще со времен древнего Рима). Соответственно, если в данном конкретном фанфике мир волшебников изображен как отсталый (в правовом отношении), то фраза судьи "не доказана невиновность" имеет право на существование.
С другой стороны, существует категория дел, в которых таки да, надо доказывать невиновность. Например, в делах о нарушении авторских прав (гражданских или уголовных, не важно) обвинению или истцу достаточно доказать только сам факт использования произведения. А вот доказывать, что использование происходит без нарушения прав, должен уже ответчик - например, показав договор с автором или показав, что использование было в целях, для которых договор не требовался.