Вот интересно, а никто не задумывался, как рождаются/формируются чувства внутри человека? Тем более отношение к другому человеку! Это сложный, лишь частично осознанный процесс, который состоит из массы предпосылок и не все из них приятные и благородные.
Где-то на уровне базы у Снейпа должно быть и это: если бы избранным был Невилл, все повернулось бы иначе.Но мальчик жив и мозолит глаза, не меньше Поттера. Снейп же правда больше всех гнобил именно этих двоих. Но гнобил скорее потому, что оба мальчика напоминали о его вине, а вина эта была так глубока и сильна, что защитный механизм вынуждал переводить стрелки: Поттер весь в отца, Невилл - опасный идиот.