Есть и другая проблема. Иногда встречается и невалидная вёрстка. И начинаются душевынимающие регекспы. Которые, мухаха, нужно ещё и поддерживать.
Спарсить самиздат довольно просто. Но оглавления там и правда не будет.

У ффф нет поддержки самиздата и сказок, в том числе в оффлайн версии, но её можно добавить при желании. Заниматься лично я этим вряд ли буду, кому хочется - есть такое: https://addons.mozilla.org/ru/firefox/addon/samlib-tools-we/

Возможно, имеет смысл сделать аддон для браузера, который позволяет скачивать произведения со всех этих сайтов. Это можно сделать и без питона, на чистом жс. Есть (по крайней мере были) скрапилки-плагины для браузера, с постраничностью и всем таким. Значит, это точно возможно. Ещё, возможно, это позволит преодолеть невалидную вёрстку, коль скоро жаваскрипт оперирует не текстом, а объектами, которые создал браузер.