Согласно тому, что я знаю, без разницы, чистить зубы до еды или после. Но я делаю это после - меньше запаха.
Рот споласкиваю сразу, идея всё таки в очистке рта от бактерий, а не в "волшебных" свойствах составляющих пасту элементов.