Kedavra
Века два назад в историю отмотайте и посмотрите, что там было с армией (спойлер: отличия заметны). Так что отработанные веками меры -- сильно вряд ли.
Ну и эпидемиологическая защита не отрабатывалась: с точки зрения логистики и экономии ресусов казарма -- идеальный способ хранения человекоединиц. (Так же как общественный транспорт для их перевозки) С точки зрения препятствия распространению заразы, очевидно, нет. Но ресурсы нужно экономить все время, а эпидемия такая чтоб с последствиями бывает раз в сто лет.
Поэтому отработанные для обычных условий решения не годятся для условий эпидемии почти никак. Но, см "традиции" и "инерция мышления", люди будут вести себя как привыкли.

Так что когда понадобилось быстро все перестроить -- очевидно, что армия подзависла.