Я думаю, он просто не выжил, а всё остальное показанное – это предсмертное путешествие по чертогам разума с посещением сцен из детства и проигрыванием сценариев будущего Ватсона.

Ещё, как вариант, во всю эту историю как-то вмешался Доктор и всё разрулил как сумел.

А если серьёзно, то, как мне кажется, он упал на тротуар, но ему всё-таки повезло, и сначала его смогли реанимировать, а потом и довольно быстро вылечить (плюс с лечении помогли секретные разработки от ведомства Майкрофта). Других вариантов там просто не может быть.