Допустим, как указано в аннотации, у Невилла далеко не идеальная память. Он помнит обиды на бабушку, но понимает, что сейчас перед ним другой человек, ещё не сломленный и не творивших по отношению к нему зла. Поэтому зачем портить хорошие на текущий момент отношения иррациональной обидой, когда объект обиды не понимает, в чём проблема.
По своим воспоминаниям Невилл понимает, что им несколько раз манипулировали, но не собирается "разоблачать дамбигада", а просто решает держаться подальше от всего, что связано с ГП. Потому и идёт на Слизерин, чтобы ни в коем случае не дружить и не общаться лишний раз с главными героями.
А выбрасывания из окна не произойдет вовсе, потому что всплеск магии у него случится от перемещения во времени, и дяде (двоюродному дедушке) не придётся выбрасывать его из окна, чтобы оный спровоцировать.