Во-первых, по канону у родителей-магов рождаются дети-маги. Сквибы рождаются редко, сам Гарри узнал о том, что школьный смотритель -- сквиб, довольно поздно и был крайне удивлен. На древе Блэков, если правильно помню, кого-то тоже выжгли за то, что был лишен магии. В принципе, дети-немаги у родителей-магов - крайняя редкость.
Опять же, не так много поступают магглорожденных в Хогвартс.
Можно на ГП-вики посмотреть список всех сокурсников (одногодков) Поттера. Даже если допустить, что все дети, статус крови которых мы не знаем достоверно, из этого потока -- это магглорожденные, то не так уж много, получается, рождается детей-магов у родителей-магглов.
Опять же, разумной будет мысль, что у такого магглорожденного среди предков есть сквиб, доминтные гены со способностью к магии от которого и передались ребенку.

Но, опять же, идея с мидихлорианами крайне интересна! =)