Строго говоря, мы знаем не "Слизерин считал, что обучать нужно только чистокровных", а что нынешние волшебники уверены, что Слизерин был против обучения магглорожденных. Реально вполне может быть, что Слизерин был, например, за предварительную подготовку магглорожденных прежде, чем начинать собственно обучение магии. Или еще что-то, а со временем информация исказилась.