Я думаю, камень настоящий. И именно поэтому проявляет известный побочный эффект - он способствует гибели своего владельца. Собственно, в сказках Бидля прямо говорилось, что только мантия условно безопасна (если вовремя отдашь ее потомкам, а не будешь цепляться за жизнь), а камень и палочка - артефакты со вторым дном, стремящиеся привести владельцев к смерти.

И не так уж важно, действительно Смерть подарила эти артефакты или их сделали волшебники, не важно, призывает камень души или создаёт проекции, основываясь на ожиданиях призывателя. Канон и на примере Кадмуса, и на примере Гарри, и просто на примере слухов о камне говорит - ничем хорошим использование камня не закончится. Так что нет ничего удивительного в том, что порождения камня радостно поддержали намерение пользователя самоубиться.

Что касается активации крестража… Очень сомнительная идея, как мне кажется. Активированный крестраж ведь не обязательно будет только защищать носителя - он может попытаться захватить его тело / подчинить или изменить его разум / просто воплотиться в сторонке, словно Том-из-дневника, использовав Гарри как донора жизненной энергии.
Думаю, на такой риск Лили могла бы пойти в самом крайнем случае, не если Гарри банально запирают в чулане, а если, например, Вернон превратил его в секс-раба, сдаёт в аренду любителям гуро и зоофилии, и планирует лет в 10 торжественно сжечь на костре, не дожидаясь письма из Хогвартса.
Да и то, Лили у нас не Волдеморт, даже если она захочет, сможет ли «активировать» крестраж? В крестражах даже Дамблдор не особо разбирался, а случай с Гарри - уникальный.