Суть гипотезы состоит в наличии стойкой корелляции, да =-) Для большинства изменений нельзя найти стойкую причину, только более-менее четкие корелляции.
Почему у птиц геном уменьшился? Возможно, чтобы избавиться от накладных расходов на ненужные гены. А может, просто из-за бутылочного горлышка с макромутацией - усиленным сплайсингом? Вероятность гораздо меньше, но исключить нельзя. И так далее =-)
Расскажите это вымершим под весом рогов оленям ;-)