Ответить "как они это делали в каноне" может только автор, если она об этом хоть на минуту задумывалась.

Я могу только предложить простой способ, благо, есть пример в реальной жизни. В Канаде для писем Санта Клаусу заведен отдельный индекс - Н0Н0Н0. Кстати сказать, на эти письма в обязательном порядке отвечают ;)

Проще всего было бы завести в Британии контролируемое магами почтовое отделение со своим индексом, работники которого все полученные для магов письма относят в совятню, а письма от магов маглам наоборот, упаковывают в конверты с соответствующим количеством марок и ставят стандартного вида почтовый штамп.
Правда, в каноне емнип Уизли присылали Дурслям письмо с анекдотическим количеством марок, но это может свидетельствовать не столько о принципиальном отсутствии маго-магловского почтового отделения, сколько о самоуверенности Артура, решившего самостоятельно справиться с отправкой письма маггловской почтой.