Нумерация ссылок в ворде делалась специальной штукой (названия не помню). И вот там нумерация работала автоматом, если что-то менять. Оглавление аналогично, страницы само считало, но вроде надо было "обновлять" на всякий случай.
У вас видимо какой-то отдельный софт, не ворд =)