Напомню про джашинитов, Ооцуки и прочие граничные случаи.
Да, души в Наруте есть, можно прокачаться так что душа работает сознанием и так далее.
Собственно, я, как и для Поттерианы, склоняюсь к своему любимому концепту - "они не мозгом думают и не только телом живут", причём это касается далеко не только как-бы-людей, там иное дерево...