Редко, но и другие авторы пишут фики с разными финалами.
Как правило, после окончания одной истории они пишут главу, где сообщают, что дальше будет альтернативный финал, начиная с такой-то главы.
Ну, и главу называют как-то соответствующе, чтобы по содержанию можно было бы понять - это новая история.