Вторую Войну Волшебников мы наблюдаем глазами Гарри, который то в Орден и не входил, плюс в самом ордене стало мало человек, да и суть то его — объеденение нескольких семей и волшебников, которые были против террора, но вот после первой войны большинство погибло, так что Орден как бы "распался", оставшиеся члены уже ничего сделать сами не могли, вот и выполняли поручения Дамблдора, не связанные с их предыдущей деятельностью.
Уверен, после воскрешения волдеморта создались пара организаций, которые имели функицию ОФ старого состава.