Для того, чтобы "нейтрализовать" Питера его не обязательно убивать (буквально или фигурально). Может Северус все же придёт к этой мысли?
Да и за что убивать ребёнка, который пока ещё ничего не совершил? И не совершит, если жизнь сложится по другому. В идеале ПП найти бы какое-нибудь дело по душе, свой круг общения, где он будет с друзьями на равных. Что-то, что поможет ему с самооценкой. И будет он жить своей собственной жизнью, а не шестерить на мародеров, в душе их ненавидя за свинское отношение.

Кстати, в каноне Питеру вроде нравилась какая-то девочка. Может здесь у них все сложится?

В общем, надеюсь, что Северус не скатится до того, чтобы заранее ликвидировать всех подряд, даже тех, кто имел несчастье в прошлой жизни просто косо глянуть в его сторону. По большому счёту проблемы могут быть только из-за Волдеморта с его стремлением устроить войнушку. Ну, может быть, ещё и ДДД, если он "гад". А если войны не будет... Со всеми остальными можно разобраться менее радикально, но от того не менее эффективно. Например, подтолкнуть ребёнка преследовать другую карьеру, дружить с другими людьми, уехать после школы в другую страну. Даже маленькие изменения/выборы в какой-то момент могут поменять жизнь человека полностью.
А ведь про эффект бабочки тоже забывать не стоит. Главный герой столько уже всего изменил, что многие люди и события теперь не будут такими, как он помнит по прошлой жизни. Тот же Питер вполне может не стать канонным Хвостом. Зато от родственников, недовольных, что Северус стал наследником Принц, вполне можно огрести кучу неприятностей. Так что СС нужно быть готовым не только к "старым" проблемам, но и к новым от неожиданных людей.