Авторский хэдканон состоит в том, что Гриффиндор, Слизерин, Хаффлпафф, Малфой в те времена - это всё-таки не фамилии. Имя рода, замка, местности и тд, но не передаваемые по наследству фамилии. Я допускаю, что названия факультетов они за неимением другой альтернативы (как Гриффиндор мог назвать в честь своего клана, коль уж он шотландец велением фантазии автора) могли придумать.