Мне кажется, не факт, что маггловские методы изничтожения на них подействовали бы. Смотря, как именно спрятаны их мэноры и прочее. Если это просто маскировка и отвод глаз - то да, бросить бомбу по координатам и никакие иллюзии и чары, искажающие восприятие, не спасут. Вроде бы, про Хогвартс писали, что магглы на его месте видят просто неинтересные развалины. Если так, то ничто не мешает магглам его уничтожить.

А вот если мэноры спрятаны в складках пространства, в неком другом измерении, куда магглам ходу нет, то бомбить бесполезно. Косая аллея, платформа 9 3/4, видимо, и другие куски волшебного мира, все, что под фиделиусом - они ведь не просто спрятаны от зрения, их действительно нет в нашем мире, они находятся в неком параллельном измерении. Ну глупость же полная, если посреди густонаселенного города вдруг обнаруживается крупное пустое пятно, на котором внезапно нет никаких построек. Так конечно, магов давно бы вычислили по тем же картам и спутниковым снимкам. Но нет, это все добро запрятано где-то в другом пространстве (возможно, и в пространстве-времени). Если так, то бомбить их бесполезно.