Поскольку Лонгботтомы были аврорами, то явно должны были владеть окклюменцией - и чтобы извлечь у них нужную информацию, требовалось проникнуть в их разум. Пытка ослабляет окклюментные барьеры, но само по себе Круцио, если переборщить с ним, привело бы к смерти. Скорее всего, там было так, как с Бертой Джоркинс.
И может быть, что Барти действительно не принимал участия в пытках. Сириус говорит, что Барти взяли вместе с Лестрейнджами, и вполне возможно, что он просто оказался в ненужное время в ненужном месте и не в той компании. А может быть, он помог Лестрейнджам найти Лонгботтомов, но не пытал их.