По-моему, зависит от того, что хотел сказать автор.
"В синем-синем море их двое:
Одна живет в донном иле, вторая его избегает"
СОздается ощущение, что в пустынном море два предмета.

"В синем-синем море их две:
Одна живет в донном иле, вторая его избегает"
а здесь кажется, что в море среди разнообразных обитателей есть два внешне очень схожих обитателя.

бедный демент, хд

madness
На мой взгляд, если бы речь шла о предметах, стояло бы "два".

слишком уж близко по тексту находятся слова "двое" и "одна".
поэтому сразу хочется исправить на "две", согласно основному правилу о числительных.
а уж точка там или двоеточие, мозгу пофиг.

Три рубля
имелись в виду предметы в широком смысле этого слова, в том числе одушевленные женского рода